中文微生物命名 附录-首版重名-同名修改对照
中文微生物命名
（《原核微生物资源与分类学词典》修正，2019年11月24日）
表1.《原核微生物资源与分类学词典》首版（2017）属名重名/同名和更改清单
序号 |
首版中文属名 |
拉丁文属名 |
发表时间/年 |
已定种数/种 |
首版页码 |
现名 |
|
|
醋杆菌属 |
Acetobacter |
1898 |
34/11亚种 |
4 |
醋杆菌属 |
|
a醋杆菌属 酢杆菌属 |
Oxobacter |
1994 |
1 |
658 |
酢杆菌属 |
|
|
蕈栖菌属 |
Agaricicola |
2010 |
1 |
|
蕈栖菌属 |
|
蕈栖菌属 |
Mycetocola |
2001 |
6 |
|
分枝栖菌属 |
|
|
素单胞菌属 |
Albimonas |
2008 |
2 |
45； |
素单胞菌属 |
|
b素单胞菌属 |
Aspromonas |
2007 |
|
104； |
已废b |
|
|
变杆菌属 |
Amoebobacter |
1888 |
4 |
68 |
阿米巴杆菌属 |
|
变杆菌属 |
Variibacter |
2014 |
1 |
984 |
裕杆菌属 |
|
|
水小杆菌属 |
Aquabacterium |
1999 |
5 |
88； |
水小杆菌属 |
|
水小杆菌属 |
Undibacterium |
2007 |
8 |
981 |
沝小杆菌属 |
|
|
水杆菌属 |
Aquabacter |
1993 |
1 |
88； |
水杆菌属c |
|
水杆菌属 |
Aquibacter |
2014 |
1 |
89； |
水杆菌属c |
|
|
水针菌属 |
Aquitalea |
2006 |
2 |
94； |
水针菌属 |
|
水针菌属 |
Hydrotalea |
2011 |
2 |
437 |
氷针菌属 |
|
|
盐水竿菌属 |
Aquisalibacillus |
2008 |
1 |
|
水盐竿菌属d |
|
盐水竿菌属 |
Salsuginibacillus |
2007 |
2 |
|
盐水竿菌属 |
|
|
沙杆菌属 |
Arenibacter |
2001 |
6 |
|
沙杆菌属 |
|
沙杆菌属 |
Ramlibacter |
2003 |
4 |
|
乷杆菌属e |
|
|
金小杆菌属 |
Aurobacterium |
1983 |
|
109； |
已废 |
|
金小杆菌属 |
Chryseobacterium |
1994 |
90 |
200； |
金小杆菌属 |
|
|
芽杆菌属 |
Blastobacter |
1961 |
5 |
|
蕾杆菌属f |
|
芽杆菌属 |
Gemmobacter |
1988 |
10 |
363 |
芽殖杆菌属 |
|
|
赤杆菌属 |
Erythrobacter |
1982 |
16 |
312； |
赤杆菌属 |
|
赤杆菌属 |
Rufibacter |
2014 |
3 |
800 |
赫杆菌属 |
|
|
黄单胞菌属 |
Flavimonas |
1987 |
|
|
已废 |
|
黄单胞菌属 |
Xanthomonas |
1939 |
32/6亚种； |
|
黄单胞菌属 |
|
|
血杆菌属 |
Haematobacter |
2007 |
2 |
385 |
血杆菌属g |
|
血杆菌属 |
Sanguibacter |
1995 |
6 |
820 |
洫杆菌属 |
|
|
黄海栖菌属 |
Hwanghaeicola |
2010 |
1 |
432 |
黄海栖菌属 |
|
h黄海栖菌属 |
Seohaeicola |
2009 |
1 |
832 |
西海栖菌属 |
|
|
泥杆菌属 |
Ilyobacter |
1985 |
4 |
|
狔杆菌属i |
|
泥杆菌属 |
Limibacter |
2008 |
1 |
|
泥杆菌属 |
|
|
光小杆菌属 |
Lucibacterium |
1970 |
|
|
已废 |
|
光小杆菌属 |
Photobacterium |
1889 |
25/2亚种 |
|
光小杆菌属 |
|
|
海小螺体属 |
Marinospirillum |
1998 |
5 |
528 |
海之小螺体属 |
|
海小螺体属 |
Marispirillum |
2009 |
1 |
529 |
海小螺体属 |
|
|
口茎菌属 |
Oribaculum |
1994 |
|
|
已废 |
|
口茎菌属 |
Stomatobaculum |
2013 |
1 |
|
口茎菌属 |
|
|
方果菌属 |
Quadricoccus |
2002 |
|
758； |
已废 |
|
方果菌属 |
Quatrionicoccus |
2006 |
1 |
758 |
方果菌属 |
a为了彻底避免重名，第658页（首版）中已作注释区别。b属名、种名和菌名加粗表示合格发表、现行有效，不加粗（正常字体）表示曾经合格发表但现已失效（由于重名、归属归种、或错误等原因）。尽管失效（已废），但其名也将永久存在，新命名时也不得使用这种已废名字。c从此两拉丁文命名来看，拉丁文已经进入为了避免重名而用词的时刻了，似已无所谓语法了；d从直译避重名；e ramlis来自阿拉伯文；f命名为蕾杆菌属更符合原意，且避重名，但修改将涉及另五属同时修改；g修改将涉及另2属和1族；h首版命名为笔误； ilyo来自希腊文。
表2. 《原核微生物资源和分类学词典》首版纲目科命名修改和增补
序号 |
内容 |
首版页码 |
备注 |
1 |
古璆菌纲（Archaeoglobea）Cavalier-Smith 2002，新纲a |
96 |
不合规 |
2 |
古璆菌纲（Archaeoglobi）Garrity and Holt 2002，新纲 模式目古璆菌目（Archaeoglobales）Huber and Stetter 2002，新目 |
96 |
合格发表 |
3 |
色杆菌纲（Chromatibacteria）Cavalier-Smith 2002，新纲b |
197 |
不合规 |
4 |
色杆菌纲（Chroobacteria）Cavalier-Smith 2002，新纲c |
199 |
不合规 |
a此纲名属于不合规命名，因为模式目古璆菌目（"Archaeoglobales" ）Stetter 1989，新目，此目并未合格发表，尚未合格发表。
b色杆菌纲的模式目肠小杆菌目（“Enterobacteriales”）并不在细菌的有效命名中，所以色杆菌纲（ChromatibacteriaCavalier-Smith 2002不合规。
c此纲常见名：绿细菌纲，绿菌纲。因为此纲的模式目色果藻目（Chroococcales）Cavalier-Smith 2002不合规，所以此纲色杆菌纲（Chroobacteria）Cavalier-Smith 2002不合规。
表3. 《原核微生物资源和分类学词典》首版门命名修改和增补
序号 |
菌门 |
发表时间/年 |
首版页码 |
||
现行中文 |
现行拉丁文a |
首版中文b |
|||
1. |
酸杆菌门 |
"Acidobacteria" |
同 |
2012 |
1086 |
2. |
放线菌门 |
"Actinobacteria" |
同 |
2002 |
1086 |
3. |
水化菌门 |
"Aquificae" |
同 |
2002 |
1086 |
4. |
铠单胞菌门 |
Armatimonadetes |
铠单胞菌门 |
2011 |
1086 |
5. |
杆状菌门 |
"Bacteroidetes" Bacteroidia |
同 |
2012 |
1086 |
6. |
烫丝菌门 |
Caldiserica |
烫丝菌门 |
2009 |
1086 |
7. |
衣原体门 |
"Chlamydiae" |
同 |
2012 |
1086 |
8. |
绿菌门 |
"Chlorobi" |
同 |
2010 |
1086 |
9. |
绿屈菌门 |
"Chloroflexi" |
同 |
2001 |
1086 |
10. |
金生菌门 |
"Chrysiogenetes" |
金矿生菌门 |
2002 |
1086 |
|
粪热杆菌门 |
Coprothermobacterota |
无 |
2018 |
无 |
11. |
蓝细菌门 |
"Cyanobacteria" |
同 |
1985 |
1086 |
12. |
脱铁杆菌门 |
"Deferribacteres" |
同 |
2002 |
1086 |
13. |
奇果热菌门 |
"Deinococcus-Thermus" Deinococcaeota |
奇果-热菌门 |
1989 2015 |
1086 |
14. |
网璆菌门 |
"Dictyoglomi" |
网球菌门 |
2012 |
1086 |
15. |
诈微菌门 |
"Elusimicrobia" |
同 |
2010 |
1086 |
16. |
纤杆菌门 |
"Fibrobacteres" |
同 |
2012 |
1086 |
17. |
厚壁菌门 |
"Firmicutes" |
同 |
1978 |
1086 |
18. |
纺锤菌门 |
"Fusobacteria" |
同 |
2001 |
1086 |
19. |
芽单胞菌门 |
Gemmatimonadetes |
同 |
2003 |
1086 |
20. |
懒小杆菌门 |
Ignavibacteriae |
同 |
2013 |
1086 |
21. |
慢球菌门 |
"Lentisphaerae" |
黏球菌门 |
2004 |
1086 |
22. |
硝化螺体门 |
"Nitrospira"或“Nitrospirae” |
同 |
2001 |
1086 |
23. |
浮霉菌门 |
"Planctomycetes" |
同 |
2001 |
1086 |
24. |
变形菌门 |
"Proteobacteria" |
同 |
2005 |
1086 |
25. |
螺旋体门 |
"Spirochaetes" |
同 |
2001 |
1086 |
26. |
协生菌门 |
"Synergistetes" |
同 |
2007 |
1086 |
27. |
软皮菌门 |
"Tenericutes" |
同 |
1984 |
1086 |
28. |
热脱硫化小杆菌门 |
"Thermodesulfobacteria" |
热脱硫化杆菌门 |
2002 |
1086 |
29. |
热微菌门 |
"Thermomicrobia" |
同 |
2002 |
1086 |
30. |
热袍菌门 |
"Thermotogae" |
同 |
2002 |
1086 |
31. |
疣微菌门 |
"Verrucomicrobia" |
同 |
2012 |
1086 |
a箭头“”表示指向现行有效名；b“同”表示首版名与现行名一致